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到了比较多的佛学思想，所以有学者说他是以佛解庄，佛道并释，“盖欲合老、释为一家”。有这种认识的学者同时还提出来，陆西星用了佛教的性空真体的思想去批判韩愈的伦理思想，意思是什么呢？陆西星对儒学有一定的不认同，而实际上陆西星是通过讲禅宗喝佛骂祖的来说明庄子批圣贤的，这是深层次的含义，哪里有瞧不起儒家的意思在里面。
有些学者还有一个观点，说在注解过程中，虽然陆西星用了大量儒家的术语、观点和思想在里面，但是他以道家的身份来注解庄子是非常明显的。得出这一结论的主要原因是陆西星在注解最重要的内七篇时，这种倾向表现得很明显。
也有学者提出来，之所以很多人对副墨中存在的一些相互矛盾的观点感觉不理解，根本原因是陆西星是对整个庄子加以注释的，而庄子本身就有问题，这无关陆西星的水平。他是在注解庄子，而不是完全自由发挥嘛。
还有大量的评价，这些观点合适与否不加评议，各有各的观识嘛。
在《南华真经副墨后序》中陆西星很明确地表达了自己的态度：“《南华经》，道德之微言，性命之极致，三教之真诠，上乘之谛义也。”因此，有很多学者说陆西星是以儒家为底色，以道教本体为根本，以禅宗体认本体的方***来注解庄子的，本就是三教互用，还纠结他用的什么身份、是用的佛解还是儒解之类的问题意义不大。
人们对副墨的评价，主流还是相当认可的。重刊的时候，萧天石作序说：“斯著则确可为第一流解本，以其不但为“《庄子》通”也，且通于《易》、《老》，尤能会通儒释旨要，彻内外各篇真诠……缘督守中，藏神守气，藏精守形，杜门而窍，返朴以全真，法自然之化，因阴阳之用，顺性命之理，通天人之数，为归根复命、圣功神化之坦途，亦长生久视、解脱逍遥之天枢，诚不失为道家一代宗师……”
就个人理解，从副墨中可以看到陆西星的三教互融已经达到了羚羊挂角、信手捻来的境界，还讨论他是儒是佛还是道的确不那么重要了。正如萧天石所说，副墨的质量在庄注中确实属于一流的，其根本不但有庄子、老子自身的层次已经是极高的原因在内，还有陆西星把二者通过道家的思想联系起来的原因，而这完全是一种极高的修为基础为支撑的。
接着看萧天石的评价：“盖陆子为东派之开祖，彻道德志本源，因阴阳之大顺，悟天地之枢机，入丹家之神室，又获深窥二氏之最上了义，自证真如，故其注斯经也，得能补偏救弊，去芜存真，发先贤之所未发，而匡历代解家之所未逮也。”
当时的首辅沈一贯也是庄子迷，在他的著作《庄子通序》中对陆西星也表达了相当高的敬仰：“余读《庄》三十年，颇有所会……既得陆长庚《副墨》，为之敛衽。”
自己家人对陆西星同样相当认同，侄子陆律在序中评价说：“自先生注出，而诸家注可尽废矣。”对自己叔叔这么赞，颇有点举贤不避亲的风骨。
清代高道傅金铨也曾作序说：“……文章德业，冠绝一时。其所著书，可谓‘黄河之水天上来"矣！”，不知道金庸小说里和现代网文里常用的那句“对某某敬仰之情，犹如淘淘江水连绵不绝”这类的说法是不是出自这里。
对副墨认同的人还有很多，比如焦竑的《庄子翼》是以它为第一参考书，林云铭写《增注庄子因》时也大量借鉴了副墨，不胜枚举。
有这样一位学者特别提一下，近八九十年前他曾说陆西星是一个连举人都考不上的学渣，凭借看过的一两本佛经，勉强改编了一本小说，结果功力不足，写出来还到处是坑。这位学者是谁后面再交待。