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在叶之镇交换获得百变怪的小智，后来经过了一个阴暗的森林，在那里邂逅并收服了一只高智商的闪光猫头夜鹰。
“我输了！”一位穿着红色外套，肩膀上还站着一只长尾怪猴的小姐姐说道。
此时，天气晴朗，小智三人和新认识的小姐姐正在一片绿荫下享受着午餐。
那名被小智打败的小姐姐叫做小凌，在附近锻炼宝可梦时，遇到了小智等人，向小智发起了挑战。
结果，可想而知，小凌败得一塌涂地。
“小智不愧是宝可梦关都的超新星训练家！”
“当然了，师父可是非常强的！”
“小智看起来很疲惫，如果想要放松休养的话，就去绿色草原吧，那里也有宝可梦中心。”
小智昨日可是连续大战，非常辛苦，小凌注意到后，指向了前方森林的方向。
“绿色草原？是不是就是那个在城都地区女孩子最想去的排行榜排第一的？”小霞貌似有些了解。
“答对了！我接下来也打算去那里！”小凌说道。
“太好了！我也一直想去绿色草原！”奈奈也是小女生非常的兴奋。
“绿色草原听说是绿意盎然的和平之地，那里吹拂的风，据说可以安抚训练家和宝可梦疲惫的心灵呢，我一直都很想去看看啊。”小霞在路上十分高兴的讲着。
就在小智四人穿过森林时，三个美少女突然愣住了。
“怎么了？”小智还在后面慢慢走着。
“师父，你看！”奈奈指着远处的结晶塔说道。
想象中的那一片苍翠的草原消失了，取而代之的的是一片冰冷的结晶，不断的蔓延，不断的吞噬着眼前的绿地。
远方，一座高耸入云的结晶塔诡异的耸立在那里，似乎是造成这一切变化的根源。
“这到底是怎么回事？”小霞非常失望的说道。
就在此时，小智的宝可梦图鉴传来了大木博士的消息。.
“小智啊，大事不好，快和我联系！”
看着图鉴上的消息，联想到面前的结晶塔，小智顿时意识到了那件事。
附近的联络点，小智成功和大木博士接通了电话。
“大木博士，到底发生什么事情了?”
大木博士的脸上有一丝愧疚，在沉默几秒后，他欲言又止地道：“其实，是关于你妈花子的事。”
“你妈妈她被炎帝带走了。都是我的疏忽！”
“花子伯母不见了？”小霞在一旁有些着急。
小智安抚了小霞，示意不要慌张。
“炎帝？”小智此时才想起，未知图腾的秘密。
“那应该是未知图腾的力量！”
“为什么这么说？”大木博士十分疑惑，小智怎么知道未知图腾的。
“博士，还是说我妈的事吧。”小智问道。
“好吧，是这样........”
在城都地区的绿色草原上，有一座庄园别墅被突然出现的神秘结晶体给完全覆盖，而且这些结晶体还持续向外扩散着。
别墅的主人是叫做修力*史诺顿，是一名以探索和研究古代遗迹而闻名的研究博士。
前不久，他突然在南方沙漠地区的一处远古遗迹里调查未知图腾神秘失踪。
接着数天后，那些神秘结晶体便覆盖了绿色草原，同时他的女儿也被困在了里面。
修力博士作为我的学生，我当然要去调查，可是，修力博士还是你妈妈花子的好朋友，我正准备叫她一起去绿色草原。
在你家前面。一只火红的宝可梦——炎帝将花子催眠带走了，我推测应该是带来了结晶塔。
对了，结晶塔内还有这个视频。
视频中是一个非常可爱的棕发小女孩，她语气十分严肃
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