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服部平次告诉他大楼被炸得彻底，他跟着服部去现场查看，什么有用的东西都查不出来，整个大楼几乎给炸得粉碎，地上留下一个深深的巨坑。里面人体遗骸拼都拼不出，更不说药物和装备器皿了。
美国拒绝交出他们带走的科学家，赤井秀一说灰原哀并不在其中，可是柯南对他的话半信半疑，毕竟FBI目前在国际上的信用已经破产，他们说的话不值得相信。以前柯南很相信FBI，因为相比起日本警视厅，FBI的行动不是那么受约束，那么可以做的事相对而言就自由的多。可现在看来，自由的太过，也不是什么好事情。尽管他们一再否认他们炸楼，可实在找不到第二个人有炸楼的理由。
服部平次和他曾经对于□□的品种和数量表示怀疑，FBI是怎么把这些□□运进日本的，这是炸了黑衣组织大楼，万一哪天他们心血来潮去炸首相府呢？他们想到，政府高层自然也想到，现在各个运输管卡严查死守，生怕再出幺蛾子。
更让柯南郁闷的是，随着黑衣组织大楼被炸，他们红方的联盟就自动解散了。因为威胁解除，所以不再需要探查黑衣组织的事情，战场转移至美国总部。可是柯南觉得很不安，琴酒下落不明，贝尔摩德不知所踪，这两个人不需要组织都能搅出血雨腥风，现在没有组织大楼这个标志建筑，他们的行踪是真正的石沉大海，根本无从找起。可怕的毒蛇潜伏起来，比之前还要危险！
琴酒吃了这么大的亏，一定会报复的！更不用说，柯南怀疑组织高层有可能都逃出生天了。
这个预感很快就被证实了，水无怜奈因为袭击英国首相被投入大牢。国际说辞是说她背叛国家，被美国CIA彻底收买，也有说法是被黑衣组织收服。但是柯南从父亲工藤优作那里得到的确切消息是说水无怜奈带回去的资料芯片上有纳米□□，炸伤了英国首相和王室贵族。
“新一，这件事不简单，你要小心。”工藤优作在电话里如是说。“为了安全起见，你尽快来美国吧。你现在的身体情况也许在美国可以得到解决的办法。”
柯南心里很矛盾，待在日本对他现在的情况已经没有任何帮助，而且这次小兰被绑架也让柯南意识到他继续留在日本只会害了兰。不管出于哪种原因，他都应该离开这里，只是……他如果走了，想再见小兰就难了。更何况，日本这里的危险还没完全解除呢……也许，琴酒他们也回美国了呢？.
柯南深深叹了一口气：算了，他再留一段时间吧，只要确定琴酒他们不在日本，他就立刻离开。等一切都解决好了，他会再回来。但愿兰……平安无事。