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路飞把藏有藏宝图的手环给了巴基，来到了第二层遇上了冯克雷，巴基解放了该楼层的许多犯人。
他们接着来到第三层遇上了r.2冯克雷，对于第三层的狱卒兽，路飞都能独自秒杀。
在四人被迫共同作战，用计击败第四层的狱卒兽后，路飞独自对上麦哲伦。
最后但由于实力差距过大而败北，身受多种毒素折磨，被扔进第五层。
路飞被r.2救出，在逃出第五层的途中，路飞挣扎起来发出霸王色霸气震昏军狼。
两人被革命军依玛祖娜救起，来到地下5.5层，最后两人被人妖王伊万科夫救了过来。
之后，路飞与人妖王以及人妖们一同前往第六层，但未能及时赶上押送队伍。
于是他们解放了被关押的克洛克达尔和甚平，和人妖们、小丑巴基解放的犯人们合作逃狱。
麦哲伦则是在犯人们的后面穷追不舍，期间，路飞等人还和黑胡子相遇，并与其过招，但被甚平阻止。
最后，r.2牺牲自己，模仿监狱长麦哲伦开启了正义之门。
路飞等人成功越狱，与r.2冯克雷挥泪道别。
路飞和其他逃狱者从天而降进入本部，路飞在找到艾斯的身影后大喊艾斯的名字。
艾斯拼命劝阻让路飞回去，路飞不听从。
克洛克达尔企图袭击白胡子爱德华·纽盖特被路飞挡下，路飞和白胡子进行了平等对谈。
路飞得到了纽盖特的赏识，之后纽盖特让队长们掩护路飞。Z.br>
汉库克偷偷将艾斯手铐的钥匙交给路飞，米霍克挡在了路飞的面前并动真格。
后路飞得到巴基和比斯塔的掩护，路飞跳上行刑台被三大将拦下并败北。
倒下的路飞再次央求人妖王为他注入治愈荷尔蒙。
后在众人的掩护下再次冲往处刑台，并在艾斯即将被处刑时展现了霸王色霸气。
看到路飞施展霸王色霸气，白胡子命令部下全力掩护路飞，大家为路飞争取了一条走向处刑台的道路。
最后，普通状态下路飞一拳击退使用剃的克比和最终于心不忍出手的爷爷卡普。
挡住了战国元帅的攻击，在r.3的协助下解救艾斯成功，二人随即共同战斗。
因艾斯之死而精神崩溃，为了捡艾斯的生命卡，路飞被赤犬袭击，结果被艾斯拼死挡下。
路飞震惊地抱着重伤的艾斯，听完了艾斯的遗言，路飞精神崩溃失去意识倒地。
马尔科为路飞挡下赤犬的攻击，要求队长们守护路飞，并请求甚平护送路飞离开。
但甚平和路飞仍遭到赤犬重创，从此路飞胸口上留下一个巨大的X型伤疤。
死亡外科医生罗，带路飞与甚平逃离现场并进行治疗。
事隔两周后路飞终于恢复意识，但仍无法接受艾斯死亡的事实，整个人变得颓废消极，甚至与甚平打架。
经过甚平一番警醒，路飞想起了自己的伙伴，哭着表示好想见他们，终于决定重新振作起来。
雷利来找路飞，向路飞提出了建议。路飞，甚平和雷利再次来到毫无准备的海军本部。
他们夺下了一艘军舰并环绕马林梵多一周进行水葬之礼，之后路飞敲响了奥克斯大钟十六下。
并在战争后留下的大裂缝扔下花束，取下草帽举在胸前默哀，然后三人撤退。
其实这是路飞为伙伴们传达右臂上的3D2Y信息，随后路飞开始师从雷利学习霸气。
两年后，路飞在汉库克的帮助下抵达了香波地群岛。
他在街上遇到了假路飞，当场用霸气将其震昏。
为了不引人注目，路飞戴上了假胡子，把假索隆和假山治是误认为是真的并跟着他们来到了假草帽海贼团面前，遇上和
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