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鲜，明政府在葛沽重新设置海防营，修筑炮台，和有关海防设施。
在大沽海口，水底布置木桩，铁链封锁港口，并且在陆地上修筑敌台。
据毕自严《饷抚疏草》记载“津门之有海防营，设水、陆二营，共5000人”。可以护送海运往饷辽东、朝鲜之兵等。
天津一带，极冲为大沽口，次冲起口，并馿驹，双沟等十余处。
还有宝坻县东南一百四十里处兴建的梁城守御千户所，主要负责的就是直沽地区的海防。
时人评价，盖海贼登岸，必由梁成所而入，于此不戒，则幕间即薄京城矣，是所守着虽一城，而所庇者则不啻于数十百里也。
由于倭乱、辽东建虏等战事，明末还专门设置天津海防副总兵官，统领天津水师。
其主要的任务就是，沿海查缉，防范和屏障京师，支援辽东和东江镇、运输粮饷等事。
这些天，一个人的到来，使得天津水师热闹了起来，有人欢喜有人忧。
茅元仪带精兵到了天津水师的驻地葛沽，经过宣旨，以及关防印信等验证、交接后，立即开始了天津水师的大规模整顿。
天津是辽东粮饷转运的一个重要基地。
从南方转运过来的漕粮，从通州由陆地用人力牛车马车运送至天津，在这里用天津水师的大型运粮船，将辽东所需的大量军粮运到觉华岛，再分散于辽东陆上各个城池寨堡。
以保证辽东的军民所需。
而用于近海运粮的海船就是遮洋船。
遮洋船容载一千石至两千石不等，船体扁浅，平底平头，全长八丈二尺，宽一…….四橹、铁锚二，舵杆用铁力木，有吊舵绳，使舵可升降。
茅元仪由于是带着任务而来，一到天津葛沽水师大营，就击鼓升帐、点卯，树立军威。
这次和他崇祯三年单身去龙武营任职，最后发生闹饷，引起兵乱大不一样。
现在他带精兵在身边，底气很足。如果营中再次发生崇祯三年他在水师龙武营那样的兵乱，他立即平之，根本就不会闹起来。
新官上任三把火，尤其是对方还带了数百的精兵，天津水师的大小将领，除了一些有病和休假的以外，所有的水师将领校尉都到了。