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过了一会儿，以大学士方从哲、吴道南为首，六部科道文武群臣到来。万历皇帝已经有二没见过群臣了，而群臣也有二没见过天颜了。
接下来，内侍先引百官至圣母灵次，百官复至御前行一拜三叩头礼。
金天启第一次看到这样的场面，毕竟以前看电影电视剧，没有亲临现场那么震撼。君临天下，百官来朝的感觉，还挺刺激的。
万历皇帝宣谕曰：“朕自圣母升遐，哀痛无已。今春以来，足膝无力，然每遇节次，朔望忌辰，必身到慈宁宫圣母座前行礼，不敢懈怠。
近日忽闻有风颠张差闯入东宫伤人，外庭有许多间说，尔等谁无父子，乃欲离间我邪？
适见刑部郎中赵会桢所问招情，止将本内有名人犯张差、庞保、刘成即实时凌迟处死，其余不许波及无辜一人，以伤天和，以惊圣母神位。”
说罢，万历皇帝拉起太子朱常洛的手，对群臣说：“此儿极孝，我极，于是下令押到朝房候旨。
方从哲等叩头，言小臣无知妄言，望霁天威。万历皇帝怒气稍解，随后搂过太子说：“彼从三尺孤养至今，成丈夫矣。使我有别意，何不于彼时更置，今又何疑？且福王既已至国，去此数千里，自非宣召，彼能飞至乎？”
又让内侍传唤三个皇孙到石阶上，让诸臣仔细看着，谕曰：“朕诸孙俱已长成，更有何说！”
回头又问太子朱常洛：“尔有何语？与诸臣悉言无隐。”
皇太子曰：“似此风颠之人，决了便罢，不必株连。”
又曰：“我父子何等亲爱，外廷有许多议论，尔辈为无君之臣，使我为不孝之子。”
于是万历皇帝对群臣说：“尔等听皇太子语否？”又重复说道，我们父子相亲相爱，外面都是谣言，你们别目无君上，陷太子于不孝之地。
群臣老老实实跪着听。而万历皇帝传旨，让慈宁宫看门的不要阻拦晚到的大臣。以至后来者踵趾相错，班行稍右，与帝座远。
万历皇帝又拉着皇太子面向右边晚到的臣子，问曰：“尔等俱见否？”
见到众俯伏谢后，皇帝吁了口气，想这事过去了，于是就让大家回去了。
甲戌，决张差于市。
乙亥，在审问庞保、刘成时候，东宫传谕曰：
“张差持棍闯宫，至大殿檐下，当时就擒，并无别物。其情实系风颠，误入宫闱，打倒内寺，罪所不赦。
后招出庞保、刘成，本宫反复参详，保、成身系内官，虽欲谋害本宫，于保、成何益？此必保、成素曾凌虐于差，故肆行报覆之谋，诬以主使。
本宫念人命至重，造逆大事，何可轻信！连日奏求父皇速决张差，以安人心。其诬举庞保、刘成，若一概治罪，恐伤天和。况姓名不同，当以雠诬干连，从轻拟罪，奏请定夺，则刑狱平，本宫陰骘亦全矣。”
六月戊子，刑部审问马三道（三舅）、李守才（外父）等，以参加非法社团的名义判处发配。
庞保、刘成则寻了个理由，在宫内杖毙了。
而多事的王之寀被科臣徐绍吉、台臣韩浚弹劾，最后削职为民。
而多嘴的刘光复冤牢役之苦。