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三郎跑去找圣神祖母，上官婉儿不让他进殿。李三郎又感到了愤怒，大喊道：
“我找我的祖母，凭什么拦我！”
上官婉儿没带过孩子，真的不懂孩子的心，想用威严吓走小孩，偏偏李三郎个性倔强，不吃这一套。争执的过程中，吵闹声越来越大，里面传出声音：
“让他进来！”
圣神皇帝拉着李三郎的小手，慈祥地看着，问道：
“小三郎，什么事一定要找祖母？”
李三郎问道：
“圣神祖母，‘君子以独立不惧，遁世无闷"，何解？”
圣神皇帝抚摸着李隆基的头，不见了慈祥，眼睛变得锋锐，眼光如杀人之刀。想了一会，脸色重回柔和，却没有了慈祥笑容，轻声说道：
“下去吧，不要再问任何人，包括你的父母、兄弟。”
长寿二年正月（六九二年十一月）壬辰朔，圣神皇帝享万象神宫，以魏王武承嗣为亚献，梁王三思为终献。圣神皇帝自制神宫乐，用舞者九百人。
李隆基几兄弟，出阁威风了数月，还没弄清楚自己的位置，又入阁，一家人禁足，不能外出。
有户婢名韦团儿，为圣神皇帝所宠信，欲与皇嗣李旦私结情缘，以提升身份地位。李旦拒不接受，惹怒韦团儿，举报李旦妃刘氏、德妃窦氏为厌咒。正月癸巳，刘、窦二妃到嘉豫殿朝拜圣神皇帝，出殿后失踪。李旦没等回二妃，不敢声张，即使见到圣神皇帝，也若无其事。韦团儿没有就此罢休，矫诏审讯李旦；圣神皇帝得知后，将她处死。
德妃父窦孝谌为润州刺史，下监察御史龙门薛季旭奏报，德妃母庞氏与德妃同祝诅。庞氏按律当斩，其子窦希瑊找徐有功喊冤，有功发碟让有司暂停刑，上奏重审。庞氏减死，与其三子流岭南，窦孝谌贬为罗州司马；徐有功除名，薛季旭擢为给事中。
腊月（六九二年十二月）丁卯，降楚王隆基为临淄王，其诸兄弟同时降爵。
春一月（六九三）甲寅，尚方监裴匪功、内常侍范云仙因私自拜见皇嗣李旦，腰斩于市；自此后，公卿以下皆难以见到李旦。
有人举报李旦身旁有异谋者，圣神皇帝命来俊臣鞠其左右。受不得酷刑，左右皆交代；唯太常工人京兆安金藏，用佩刀剖胸腹以自证皆出，流血被地。圣神皇帝听说后，让医官救治，以桑皮线缝合，再敷药。老天有眼，一夜过去，安金藏苏醒过来。圣神皇帝亲自探望，叹曰：
“吾有子不能自明，使汝至此，”
渡过这一难关，一家人从惊恐中暂得平静，闷在小院里，不能外出，不能见外人。一家人无事可做，只能读书、写字、赋诗、作画，乃至音乐。人的时间有限，忙碌的人时间不够用，欲向天借；富贵的人觉得享乐的时间太少，欲成仙成神；禁足的人总觉得时间太长，不知道如何去消磨漫长的时光。于是，李隆基兄弟有足够的时间，学习所有能学的东西。李旦懦弱，学问不差，琴棋书画，样样精通，教导自己的孩子，绰绰有余。这也是李旦为数不多的乐趣，既是责任也是消遣。