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城外起义军，于是下令屠杀马尼拉明人。
西班牙人逐屋搜查，见到明人就直接杀死。
据史料记载，这场针对大明子民的屠杀，造成两万四千多人死亡。
可这只是西班牙殖民者在吕宋屠杀明人事件之一。
万历三十一年，有二万三千多明人遭受屠杀，仅有三百多人免于其祸。
原来明朝与西班牙殖民者共同围剿林凤、林道干等海盗，关系较为融洽。
后因西班牙强役华人二百五十人，入侵香料群岛的明朝属国摩鹿加，结果操舟稍怠辄鞭挞至死，遭潘和五等人反抗，杀死西班牙吕宋总督达斯麻雷那斯等人。
后西班牙驱逐所有明人商贾、惟利之所趋，明人在城外仍慢慢聚集。
当时大量白银从吕宋及日本进入大明，造成明末通货贬值危机。
历经三大征的万历皇帝，听从矿税使者阎应龙、张嶷所言，派遣张嶷、海澄县丞王时和、百户干一成，前往吕宋机易山勘矿。
吕宋原为明朝朝贡国，但朝廷根本弄不清楚，以一张牛皮圈地诓骗吕宋原住民。
西班牙殖民者认为在吕宋明人可能是内应，大明可能会袭取其国，潜谋杀之。
隔年西班牙诓骗明人攻打旁国，并高价收购铁器，明人贪利尽鬻之，于是家无寸铁。
西班牙总督下令，录明人姓名，分三百人为一院，入即屠杀，明人无兵仗抵抗，死无数，奔大仑山。
饥困于山中后，开始攻城，遭遇西班牙埋伏，前后死者二万五千人。