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了来意，又当面权衡利弊。郑芝龙被说服了。
不久，摄政王多尔衮收到洪承畴的奏报。内言郑芝龙拥立唐王朱聿键，以拥戴元勋、开国功臣自居，手中又掌握着几十万军队，控制了隆武朝的一切大权。
他还将南明小朝廷的情况告诉给多尔衮：郑芝龙搜刮民脂民膏，滥征商税，加派、预征田赋，卖官鬻爵。官职的价格多者数百两，少者数两银子。拿钱买得官爵的人，上任后就大肆敲诈，大捞一把，闹得民不聊生，怨声载道。
当然，郑芝龙同意归顺大清的意愿，洪承畴也在信里告诉了多尔衮。说郑芝龙眼看隆武政权没啥希望，为了保护自己广遍闽粤的田园、“富甲侯王”的财产和身家性命，他愿意与清廷合作。
终于，洪承畴与郑芝龙私下合谋，密定成约。清军于顺治三年进攻福建，郑芝龙将长达两百里的仙霞岭防线的守军完全撤走，实践其投降诺言。水陆两路，皆不抵抗，以示投诚于清朝。清兵得以长驱直入，拿下福州。
清兵进军福建时，隆武帝朱聿键正在延平。他听说清军已经杀来，于是急忙出奔汀州；后来，在汀州被清军追上杀死。隆武政权宣告灭亡。
国师李纯风言，大明紫金山龙脉内龙穴已损，王气渐渐消散，需十几年；可是人家清廷摄政王多尔衮可不愿让南明小朝廷多十几年的存在呀，他认为这个南明小朝廷存在几年就行了。
多尔衮过于有违天意，后遭雷电劈死。此为后话，先点一笔。他太急于求成了。
清军入闽后，以闽粤总督的官衔为诱饵，对郑芝龙进行招降。其子郑成功坚决反对降清，向父亲列出了各朝历代降臣的下场。但是，郑芝龙利禄熏心，不听郑成功苦劝，献印剃发，自己跑到清营投降。
郑芝龙投降后，被连哄带骗地送到北京软禁起来，闽粤总督的美梦落了空。此刻他后悔不已，后悔没有听郑成功的劝告。
郑成功见清廷对父亲如此不讲信用，遂率领战友至广东南澳，树起“背父救国”的大旗，招集旧部，进行抗清斗争。
有人向多尔衮献策：让郑芝龙劝他儿子郑成功，归降大清。
一日，摄政王多尔衮召郑芝龙来府上，让他书信一封，劝其子郑成功归顺清廷，并承诺云云。郑芝龙寄人篱下，只得手书一封劝降信给儿子郑成功。甚至寄希望于他，能够保住全家性命。
然而郑成功早已将清廷摄政王多尔衮的嘴脸看清，自己的父亲投靠你们，下场如何？不就是一个例子吗？所以，郑成功当着使者的面大骂多尔衮，且拒不投降。
使者把郑成功的言行所为，以及对清廷的态度转述给了摄政王多尔衮。多尔衮听罢，许久不语，看来，这郑成功明摆着是要与朝廷抗争的了。
不久，郑芝龙全家老小都被清廷处死。郑芝龙万万没想到，拥立前朝皇裔朱聿健称帝，建立南明朝廷，在鼎盛时期也曾经占有半壁江山。可是最终，如同演了一场历史戏剧。