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随着各大舰队如火如荼的开展人员审查工作，舰队的另一面缺陷等问题也便同时浮出了水面。
首先是面对三体舰队入侵时，欧洲舰队与亚洲舰队的指挥控制权仍然还是处于各自为战的尴尬处境。
虽然名义上舰队是归太阳系舰队联席会议管辖与统率，但实际舰队指挥控制权仍掌握在各国手中。这在备战时期当然没有什么问题，但当三体舰队地球太阳系时这就将会成为一个大问题。
在面对三体舰队的攻击时如果没有统一的指挥部署，人类舰队的实力无疑会得不到全力的发挥。这在特别是两个文明间生死存亡的战争中更显得尤为重要。
因此，在面对三体危机时各国都必须放下偏见，为人类文明的延续必须做到团结统一。所以舰队统帅控制权的整合联合国以及太阳系舰队联席会议势在必行。
对此曙光舰队自然也是双手赞成，毕竟这能进一步加强曙光太空中的话语权。
而另外一方面就是人事问题，此前舰队司令部的组建是由各国高层人员共同组建而成，因此对军官的调度、升迁等人事权同样也是掌握在各国的手中。
但是各国为了加强各自在舰队内的话语权，不断往舰队里加塞人员，这同样导致了舰队军官臃肿，管理职责与范围混乱不清等情况的出现。
因此舰队司令部的审查工作进行到了最后反而逐步演变为了舰队司令部的改革行动。当然，经过全部的人员审查之后并没有再发现地球三体组织的残余分子，这让很多人不免的松了一口气。
很快，随着改革的逐渐进行，各国对舰队的控制权逐渐减弱，逐渐转变为由太阳系舰队联席会议统率所有战舰。
当然，各国在太阳系舰队联席会议之中也会有着属于自己的席位与话语权，不然的话各国是不会轻易下放舰队的控制权的。
事实上，各国已经从直接控制舰队正逐步过渡到了通过太阳系舰队联席会议间接控制舰队。做到这一步，真的是非常不容易，其中联合国和太阳系舰队联席会议在其中付出而来很大的努力才使改革的顺利进行。
而从此以后，欧洲舰队以及亚洲舰队将不再属于某些国家，而是作为抵御三体文明入侵的人类整体舰队形式存在，这无疑会淡化了国家在舰队中的影响力。
对于太阳系舰队联席会议来说无疑是乐得看到这一幕的，而各国为了更好抵御三体文明的入侵也只能融合进世界大环境中。
时间很快就过去了两个月，而舰队司令部的调查也已经基本结束，结果自然是再也找不出第三个地球三体组织的余孽了。
这早在各国的意料之中，因为从之前这两个地球三体组织残余分子同时行动时各国就知道，那次一定是一个绝好的时机，肯定会倾巢而出，无论行动是否成功都会引起舰队司令部与各国的重点关注与监视，这样以后他们就很难再回有这样千载难逢的机会了。
随着对地球三体组织残余分子调查的结束，各大舰队的改革同时也在迅速推进着。
这次的舰队司令部发现地球三体组织残余分子对太阳系舰队联席会议来说可以算的上是一个趁机推进舰队改革的好时机，并且为了防止各国在此事件过去后临时反悔又不愿意下放舰队控制权，太阳系舰队联席会议特别加快了舰队改革。
目前，改革进度已经基本接近了尾声。舰队的控制指挥权目前已经移交给了太阳系舰队联席会议，同时也下放了部分权力给舰队司令部进行内部灵活调整。
随着舰队司令部的权力逐渐增大，舰队总司令很快一改往日舰队臃肿不堪的人员架构以及行政体系。一时之间，亚洲舰队与欧洲舰队一改往日的颓靡之势，露出了一片蓬勃发展的新气象。
权力的下放无疑会使舰队的战斗力和凝聚力得到一定程度的提升，这在太阳系舰队
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