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具鞭毛的藻类的统称。鞭毛藻依托神奇的鞭毛，能主动运动，不像许多海藻，或固定在某处，或随风浪漂流。
小波问。“鞭毛藻为何可以发出蓝色荧光呢？”刘傻子教授说：“美国哈佛大学海洋生物学家伍德兰德·哈斯廷斯通过实验发现，鞭毛藻体内有独特的蓝色荧光基因。这种基因能控制细胞膜内的一种特殊蛋白质，令细胞膜开通一条可以产生电流的通道。”
王可博士说：“电流通过这条通道之后，刺激鞭毛藻的荧光蛋白发出荧光。如果通过基因工程的方法关闭荧光基因，鞭毛藻就不再发出荧光。鞭毛藻很小，体长只有50微米。海水中的单个鞭毛藻，靠肉眼是看不到的，单个鞭毛藻发出的荧光也很微。”