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在时朝廷年入一千三百万担，银八百万两，如今朝廷还不及此数一半，实则天下土地被功勋宗亲侵占，民间又有寄田于官家逃避赋税，致使国家财政枯竭入不敷出。还望卿等为江山计，不要计较个人得失。”.
方从哲又言道：“功勋之家祖上为大明江山出生入死，若让他们交税必会寒心，祖宗成法不可变。”
方从哲说完叩首请命，多数大臣也都叩首附议，其声整齐，震彻殿堂。满殿大臣们唯有孙承宗、徐光启、宋应星、侯光远等少数大臣纹丝不动，既不敢附议，也不敢上前陈词劝说，朱由校孤零零的站在御座上，显得孤影单只。
这是朱由校登基以来第一次遇到的阻力，是来自满朝文武的阻力。朱由校真真切切的感受到文官集团强大的势力，一股凝结对抗皇权的力量，让朱由校倍感不爽。
打破功勋官绅特权，是朱由校既定的国策方针，这决不能更改，不管你们愿不愿意都必须执行。朱由校不管他们在下面跪呼“请陛下收回成命，恪遵祖宗成法”之类的话，提高嗓门大声道：“户部清查京畿地区田地三日登记造册，天启二年起按亩征收赋税，每亩输，按照官价计征银钱，徭役可按价折算，丁银以亩计收，废除以丁计收。泰昌元年十一月，全国清丈田亩，天启元年十一月完成，天启二年赋税征收按新法，饬令各省奉行，怠惰执行不力者，巡抚州县主官一律罢免拿京问罪！”
这是明显的“一条鞭法”的核心内容，正是张居正当年改革的重心，大臣们对此并无多大异议，因为征税只不过是把交实物换算成了银钱而已。大臣们感到新颖的是取消丁课，也就是取消了人头税，按亩计收，这也就是历史上著名的“摊丁入亩”。
朱由校的金口一出，诸大臣震惊。孙承宗更是叫苦不迭，要推行全国阻力可不是一般的大了，也不像京畿地区这样，好歹是硬着头皮完成了，元老重臣及有名的土地大豪绅的田地主要集中在南方，还有不少藩王的田地也在南方，这必然触动他们的根本利益，可见这将是一场不可见的刀光剑影。
朱由校的话说完，大殿内鸦雀无声，片楞之后无人回应，诸大臣都在看着孙承宗。孙承宗更是凝神沉重，他知道，皇帝已经将他推到了大臣们的对立面了，谁都看得出来，此时就孙承宗几个是皇帝身边的红人了。
朱由校见无人应道，又大声喊道：“户部何在！”
孙承宗惊榷，在众人的注目下，他艰难的走了出来，忐忑跪下。孙承宗此时已经入阁兼任户部尚书，无疑这艰巨的责任由他去担。
朱由校见到孙承宗出班列跪在方从哲旁，大声问道：“朕的话户部听清了吗？”
孙承宗伏地叩请，毫无底气的回道：“微臣领旨。”
虽然声音较小，但在如此安静的殿内都能听清。
散朝后，大臣们满腔的哀怨之气在午门外发泄了出来，许多大臣们对方从哲不能力谏皇帝表示不满，也对孙承宗极为讽刺。
回到内阁，三位阁臣，方从哲、韩爌、孙承宗在一起明显分成两派，孙承宗自不必多言，孤单影只，面对三人不满的眼神，深感不安。
方从哲首先开口说话，“我等受先帝厚恩，遗命辅佐天子。如今天子年少，不懂治国，违背祖制，征缴功勋之家赋税，这必使天下寒心，将来谁还肯为朝廷效力。我身为内阁首辅，不可坐视不管，对皇帝的的旨意，内阁决定‘封驳"，不予执行下达，众位以为如何？”
方从哲是“浙党”之首，韩爌是东阁大学士，东林党元老，孙承宗与“东林党”关系密切，内阁三位辅臣虽然关系不睦，争争吵吵，底下的人也是互相倾轧，但在土地清丈和统一赋税问题上方从哲和韩爌是一致，那就是反对！干了这多年的阁老大臣谁家没点良田，谁愿意缴赋税？！孙承宗家中资产少，对他来说无所谓。
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