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法用钱来赎罪。而在案件查办过程中，还发现了林永升的家人薛元收受王伸汉贿银一百两的证据，他被判处杖六十，徒刑一年，以示惩戒。
至于此案的主犯王伸汉，他的罪行更是罄竹难书。嘉庆皇帝愤怒地指出，王伸汉不仅贪污了两万多两救灾款，还残忍地谋杀了李毓昌，这样的罪行已经法无可恕。于是，王伸汉被判处立即斩首之刑。而他的贪污款项，除了查抄家产外，还被勒令由他的亲属赔偿，以示法律的威严与公正。
嘉庆皇帝对于这起案件的处置，可谓雷厉风行，毫不留情。对于那些有罪人员，他严惩不贷，展现了皇帝的威严与公正。而对于受害者李毓昌，这位清正廉洁的官员，嘉庆皇帝则是毫不吝啬地给予了丰厚的奖励。
他亲自下旨，追封李毓昌为知府衔，按照知府的规格赐予恤金，这是对李毓昌生前清廉勤政的认可与褒奖。同时，他还按照四品官的待遇，赐予李毓昌全葬银二百两，一次致祭银十二两，让他的身后事得以隆重而庄严地办理。
为了让李毓昌的事迹能够永载史册，嘉庆皇帝下令将其事迹宣付史臣，列入循吏传，让后人能够铭记这位清官的功德。李毓昌虽然没有子嗣，但嘉庆皇帝却恩准将其侄李希佐入继为嗣，并加恩赏给举人功名，让李家的血脉得以延续，同时也让李毓昌的在天之灵得以安息。
此外，嘉庆皇帝还亲自为李毓昌创作了《悯忠诗》五排三十韵，以表达对这位忠臣的哀悼与敬仰。他不仅捐资一千余两，还命令地方官员在李毓昌墓前修建悯忠诗碑楼，将自己的诗句镌刻在石碑上，让后人能够永远铭记李毓昌的忠诚与贡献。
能够得到皇帝亲自嘉奖的官员本就不多，而像李毓昌这样的知县级别的七品官更是少之又少。但正因为他清正廉洁、勤政爱民，才赢得了嘉庆皇帝如此厚重的嘉奖。李毓昌所受的恩遇，可谓是“旷古未有的恩典”，这也成为了他一生中最为光辉的篇章。