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蓟州镇、辽东都指挥使司、保定府大宁都指挥使司的军务兼理粮饷，并且经略御倭。
然而明都察院右佥都御史还未至，就先上奏十事，其中有令李氏朝鲜王国官民输粟，得增秩、授官、赎罪，以及乡吏丁夫等免役。
又以李氏朝鲜王国君臣隐匿钱粮，不饷援朝明军，劾奏其罪，因此李氏朝鲜王国官民们多怨杨御史。
这时李舜臣在狱中遭到严刑拷打，可能有性命之忧！
为此李氏朝鲜知中枢府事：郑琢，就上了一道《伸救箚》历数李舜臣的功劳，为李舜臣辩护，还请求李氏朝鲜郡王开恩特赦。
才让李氏朝鲜郡王同意免李舜臣一死，并让他再度白衣从军，时为明万历二十五年公元1597年、宣祖三十年4月初1日。
但是此前李舜臣的老母：卞氏，便得知了李舜臣入狱，开始忧虑成疾，不久便逝世。
4月13日，李舜臣听说母亲去世的噩耗，连忙赶回忠清右道牙山县奔丧，他悲痛地说道“朝鲜语：欲忠于国而罪已至，欲孝于亲而亲亦亡！”
随在忠清右道牙山县待了三日后，就辞别母亲灵筵，继续在李氏朝鲜都元帅：权栗，的麾下白衣从军，来尚庆右道草溪郡开始服役。
而李氏朝鲜都元帅则下令趁倭军初到，立足未稳，让新上任的李氏朝鲜三道水军统制使：元均，率所部李氏朝鲜水师攻击尚庆左道庆州府釜山浦，打算全歼幕府全部水师力量。
6月19日，李氏朝鲜三道水军统制使舰队从尚庆右道闲山岛出发，向东开进。
半路上，就遇到了幕府第五军下参议：岛津义弘，和幕府民部少辅：高桥统增，部下的小股巡逻舰队，只经过短暂的交火，李氏朝鲜三道水军统制使即下令全军撤回大本营！
结果首次攻击无功而返。
这让李氏朝鲜都元帅对李氏朝鲜三道水军统制使这种三心二意的态度十分恼火，便再次督促他向釜山浦进攻。