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小智等人在漫长的旅行之后，所来到的地方，是看起来有些破败的城市，黑云市。
湛蓝的天空被黑色的工业废气所遮挡，从海面吹来的风，闻起来带着臭泥的气息，影响路过的心情，不过这次的故事，就是从这里开始的。
“这个地方工厂林立，可是怎么看起来冷冷清清的？”
“这里好像叫做黑云市耶。”
“黑云市？没听说过。”
“听说这里以前，因为到处是工厂，所以很繁华喔。”
“也正是因为这个，所以天空和大海都受到了污染，黑云市便变得没落起来了。”
“看来这里不大可能有神奇宝贝存在了。”
皮卡丘因不适应环境的原因，开始控制不住的对“漏电”，并表现出类似重感冒的症状。
“皮卡丘，你怎么了？”
皮卡丘难受的昏倒在地上。
“啊？皮卡丘，你振作起来一点啊。”
小智将不停冒着电的皮卡丘抱去，按着城市地图的指示，向着神奇宝贝中心狂奔。
“皮卡丘，你振作一点，不要担心，我现在就带你去神奇宝贝中心。”
三人跑进神奇宝贝中心后，路上的井盖被掀开了，喵喵从下水道内爬了出来。
“他们真的跑到神奇宝贝中了耶，喵。”
听到喵喵的话，下水道中传来两道声音。
“为了防止世界被破坏。”
“为了守护世界的和平。”
小次郎与武藏想说完开场白，但下水道的气味不允许。
“呕。”
“哎呀！再也受不了，这是什么臭味嘛，真是恶心死了！”
听着两人的抱怨，喵喵拿出几件准备，丢了下去。
“装上我准备好的潜水服吧，我会用电帮浦送入新鲜的空气给你们的，喵。”
“啊~又活过来了。”
“你有这种好东西，干嘛不早说啊？”
“你这个笨蛋。”
“你们两个不要再报怨了，快点潜入那臭泥水里面去，喵，再从那里潜入神奇宝贝中心，再来该怎么做就知道了吧，喵。”
“开什么玩笑！你这是什么自大的态度啊。”
“我们是可爱又迷人的反派角色诶，就算是为了得到全世界独一无二的皮卡丘，要我们潜入臭泥海，不干！”
“对，说的对，这种事情我绝对不干，不干，哼！”
听到这话，喵喵笑了笑，拿出一个遥控器按了一下，小次郎和武藏所穿的潜水服便开始电击二人。
“你们不听话就会这样，喵。”
二人无奈，只好潜入臭泥海。
“可恶，你给我记住。”
“今天让你得逞，下一次你就没机会了。”
回到小智这边，在发现前台没人后，一直在那按着传叫钤。
“有人在吗？有没有人在啊？”
被吵醒的乔伊小姐，伸着懒腰，从休息室里走了出来。
“哎~嗯，真受不了耶，你不知道现在几点钟吗？普通好孩子呀，这个时候都已经睡觉了。”
“对不起噢，我的皮卡丘的情况，有点不对劲。”
“啊~大概是感冒吧。”
“你仔细的看看啊，它是我最重要的神奇宝贝耶，你的姐妹家都很照顾神奇宝贝的。”
乔伊小姐又打了个哈欠。
“不要急，不要急，你看，皮卡丘在昏迷后，脸颊的电囊还有放电出来呢，这个是电气鼠神奇宝贝感冒后的初期症状，只要让它在这里待一个晚上，很快就治好了。”
“我说……”
“嗯？”
“我想要说的是，有人跟我说，你是乔伊众姐妹中最怪的一个。”
“嗯哼~，不对
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