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第二次的分裂是巫族内旧巫和新巫的分裂，祛除掉魔门的一支，巫族的内斗仍旧没有停止，一直到三位巫族旷世天才横空出世，建立以道为核心的全新教派：道教。
道教脱胎于巫族，但经过三位旷世天才费心心血的整理和归纳，舍弃掉巫族中原始和血腥的部分，精细划分出规范的修行境界，功法也是精挑细选的直达大道传承功法，走火入魔和步入修炼歧途前路断绝的可能性大为降低。
道教很快在巫族内部留传开得到大量巫族的拥戴，影响到传统巫族强大势力的统治地位，通过数万年与巫族传统势力连番大战，终于取代传统巫族在洪荒大世界的统治地位，占据中州和东州，将传统巫族驱赶到北州和南州。